Манастир је смештен на стрмој обали мора на североисточној страни Свете Горе, између манастира Пантократора и Ивирона. Предање казује да се на овом месту у давнини спасавао неки Никита, који је израђивао крстове. Ставроникита значи “крст Никите”.
Од давних времена овде је постојао манастир, посвећен светом Претечи Господњем Јовану, са истим називом Ставроникита. У периоду крсташких похода и најезди Сарацена, манастир је разрушен и опустео.
Манастир је обновио и основао Патријарх цариградски Јеремија I. Тада је он посвећен светом Николају Чудотворцу, захваљујући проналажењу иконе светог Николаја Чудотворца. Године 1553. њу су у присуству патријарха рибари извукли из мора. Према предању, ова икона је била бачена у море од стране иконобораца. Дуги низ векова ова икона израђена у мозаику налазила се у мору оставши сасвим цела.
Манастир је један од најмањих по величини, утврђен је каменим зидинама са високом кулом, а келије су смештене на врху зидина.
Саборна црква у име светог Николаја Чудотворца грађена је у XVI веку а сачуване су и прекрасне фреске из тог века, рад Теофана Критског, чији је живопис остао очуван и у трпезарији манастира.
Осим чудотворне иконе светог Николаја Чудотворца, међу манастирским светињама чувају се и део животворнога дрвета Крста Господњег, као и делови моштију многих угодника Божијих међу којима и светих: Василија Великог, Јована Златоустог, Григорија Богослова, архиђакона Стефана, Четрдесет Мученика, Теодора Стратилата, Амвросија Медиоланског, Јована Претече и других.
Осим Саборне цркве овде постоји још седам параклиса.
Библиотека садржи ретку збирку древних рукописа и књига.
ЧУДОТВОРНА ИКОНА:
ФОТОГРАФИЈЕ МАНАСТИРА: